Астрахань была третьим после Москвы и Петербурга городом, где в 1721 году по распоряжению Петра I открылась Государственная аптека. В музее представлена уникальная в своем роде коллекция предметов для ухода за больными, которые датируются III ст. до н.э. В их числе щипчики из кости, раковина белемнита (предшественника современного кальмара), порошок из которого служил для врачевания ран. В музее можно увидеть медицинские инструменты, книги, интерьеры аптеки и врачебного кабинета конца XIX-начала XX вв. Особое место отведено выдающимся медикам и целым династиям врачей. Отдельный выставочный зал отведен для выставок, освещающих памятные события в области медицины.