Как и большинство других краеведческих, магнитогорский музей основной упор делает на создание экспозиции, отражающей богатство и разнообразие животного и растительного мира родного края. Особый интерес для посетителей составят археологические коллекции, сформированные в результате раскопок в районе Магнитогорска учеными-археологами Т.В. Сальниковым, О.Н. Бадером, Г.Н. Матюшиным, Ю.Ф. Рыжовым.
На постоянной экспозиции музея «История Магнитки - история страны» собраны фотографии, отражающий историю Магнитогорска со дня строительства до настоящего времени. В музее имеется научная библиотека по краеведению (около 13 т. томов).