Когда в 1967 году музей только открылся, он был совсем небольшой и назывался комната боевой и трудовой славы КТИРПиХ. За годы работы, накопился большой объём материалов, поэтому было решено расширить музей, предоставив большее помещение и штатного сотрудника. Обновлённая экспозиция была посвящена 50-летию вуза и открыта 23 февраля 1981 года.
Сейчас музей КГТУ представляет собой музейный комплекс, в который входит галерея ученых КГТУ, мемориальная аудитория, галерея Боевой Славы, а также ряд экспозиций и зал тематических выставок. В коллекции музея составлены из материалов по истории рыбохозяйственного образования и университета. С 2008 года при музее работает студия декоративно-прикладного искусства, объединяющая студентов, сотрудников и выпускников.
