Музей работает с 1887 года, когда основу его фондов составили сборы обитателей Северного Ледовитого океана, предоставленные экспедицией Н.А. Эрика Норденшельда, совершавшей сквозное плавание на пароходе «Вега» из Атлантического океана в Тихий. Сегодня здесь демонстрируются собрания с территории Алтая, Западной Сибири, Казахстана и Монголии, Восточной Сибири и Приморья. Посетители могут увидеть таких редких обитателей нашей планеты, как киви, гаттерии, совиный попугай, сатира и пр. Уникальные виды насекомых, лучеперых и хрящевых рыб, земноводных и пресмыкающихся производят незабываемое впечатление на посетителей.