С 1991 г. музей является филиалом Астраханского музея-заповедника. Экспозиция освещает историю основания города-крепости, знакомит с основными занятиями населения. Музей располагает интересными материалами о черноярском казачестве. Действует стационарная выставка «Природные особенности Черноярского района». Отдельный раздел отведен участию черноярцев в ВОВ, вкладу в победу над гитлеровскими войсками под Сталинградом.
