Поначалу музей был кабинетом зоологии, в котором с научной и просветительской целью, собирали коллекцию позвоночные. В музее есть экспонаты, которым более ста лет! В прошлом веке музей стал пополняться экземплярами, привезенными из экспедиций.
Основой фонда является научная коллекция, которая активно используется российскими и зарубежными учеными. Сегодня в экспозиции музея насчитывается почти 15 тысяч экспонатов. А коллекция мелких млекопитающих вообще считается одной из самых больших на Дальнем Востоке и в Сибири.
