Экспозиция музея размещена в самой древней из уцелевших до наших дней каменных церквей не только в Иркутске, но и в Восточной Сибири. Здание церкви, в ту пору собора, было освящено 1 августа 1710 года. После окончания реставрации здания Спасской церкви, в 1982 году в ней открылся демонстрационный зал, который посвящен истории Иркутской епархии. Панорамные панно фасада церкви изображают: в центре — крещение Христа, левая часть композиции изображает обряд крещения бурятского населения, правая — причисление к лику святых Иннокентия Кульчицкого, первого иркутского епископа.
