Одним из первых инициаторов создания Белозерского местного музея был гласный Белозерской думы Н.А. Шоленинов, выступивший в 1916 году с докладом на заседании Новгородского церковно-археологического общества. Музей был создан в помещении бывшего винного склада в 1918 году на основе богатейшей коллекции бронзы князя С.С. Абомелик-Лазарева. Музей просуществовал в ведении отдела образования до 1954 года и был закрыт "как не соответствующий своему назначению и не имеющий условий для развития", а наиболее ценные экспонаты были переданы в Кирилло-Белозерский музей.
В 60-е годы благодаря учителю истории Р.А. Новиковой началось возрождение краеведческого музея. Сначала в средней школе № 2 был создан историко-краеведческий кружок. На основе находок, добытых в археологических экспедициях, а также материалах собранных учениками о земляках-участниках Великой Отечественной войны, о революционных событиях в крае, о первых комсомольцах Белозерья и развитии народных ремесел, была создана коллекция из более 4000 предметов.
В 1967 году на базе школьного кружка был организован народный музей, для которого выделили помещение в здании местной библиотеки, где разместились первые экспозиции: "История края" и "Народные умельцы".
Уже в 1976 году народному музею присваивают статус государственного и выделяют огромное помещение в старинном особняке – доме Ананьевых. В течение последующих 35-и лет, почти каждый год приносил музейным коллекциям все новые и новые экспонаты. Музей рос и расширялся. В июле 2008 года музей получил новый статус государственного учреждения культуры и новое название "Белозерский областной краеведческий музей". В начале 2010 г. в структуре музея произошли изменения - был создан научно-просветительский отдел.
На данный момент музей экспонирует архитектурные памятники: Белозерский кремль, церковь Ильи Пророка, церковь Спаса Всемилостивейшего, Петропавловский храм, церковь Иоанна Предтечи, мост через крепостной ров, дом Копорулина, церковь Покрова Богородицы, иконостас Спасо-Преображенского собора и торговые ряды.
Отдельно выставляются коллекции народной игрушки, резчика по дереву Д. Дорогова, ямских колокольчиков, картины В.Н. Корбакова. Постоянные экспозиции музея: «Русская изба», «Музей природы», «Дом-музей поэта С. Орлова», «Стоп-кадр».
